Naše gymnázium se v průběhu let zapojilo do řady projektů podporovaných městem Plzeň, Plzeňským krajem, MŠMT i Evropskou unií.
Tím největším byla patrně rozsáhlá rekonstrukce půdní výstavby v roce 2010, díky níž se škola rozrostla např. o výtvarný ateliér nebo o specializované učebny informatiky, společenskovědních předmětů a jazyků.
V současné době realizujeme řadu vzdělávacích aktivit díky projektu Šablony, který je financován z Operačního programu Jan Amos Komenský (OP JAK).

Šablony na Mikulášském gymnáziu 2025
Vzdělávání 4.0 v Plzeňském kraji
Rekonstrukce odborných učeben a laboratoří biologie a chemie
Zefektivnění a zkvalitnění přírodovědného, technického a jazykového vzdělávání a modernizace učeben na Gymnáziu, Plzeň, Mikulášské nám. 23
Podpora technického a přírodovědného vzdělávání v Plzeňském kraji
Rozvoj vzdělávacích kapacit Gymnázia Mikulášské náměstí 23, Plzeň
Blended learning ve vyučovacím procesu na gymnáziu
Prevence digitální propasti a Digitální učební pomůcky 2023